21 июня 2001 года на внеочередной сессии районного Совета депутатов был утвержден герб Онгудайского района, проект которого предложили Б.Киндиков и А.Епишкин
За основу герба района взято стилизованное изображение грифонов из Туектинских курганов скифской эпохи VI - V в.в. до нашей эры. На протяжениии многих столетий грифоны имели божественное, святое значение для проживающих на Алтае народов.
Грифоны - охраняют очаг - символ благополучия и мирной жизни народов Алтая.
В верхней части герба изображена трёхглавая вершина горы Белуха, символизирующая духовность и вечность. Из Белухи вытекают реки в виде орнамента, обозначающие смену и преемственность поколений.
В нижней части -изображение коновязи - символа гостеприимства и чистоты намерений. Рядом с коновязью - окружность - древний знак объединения и пересечения четырех сторон света (Онгудайский район - географический центр республики).